La missió del CNAG és dur a terme projectes de seqüenciació i anàlisi d’ADN en col·laboració amb investigadors de Catalunya, Espanya i de la comunitat científica internacional. Actualment, el centre opera amb diversos tipus de seqüenciadors d’Illumina, Oxford Nanopore Technologies i PacBio, oferint als investigadors accés a tecnologia d’avantguarda per a la seqüenciació d’alt rendiment en una àmplia gamma d’aplicacions. El parc de seqüenciació compta amb una extensa infraestructura informàtica de suport.